免疫系统会失控并开始攻击健康的细胞、组织和器官。然而，这是以高度选择性的方式发生的。在大脑自身免疫的情况下，免疫系统会引发针对大脑或神经组织的自身免疫反应。

免疫系统和神经系统是相互关联的（如图1所示），这种关系是由化学信使介导的，例如由免疫系统细胞如 T 辅助细胞 (TH)、T 抑制细胞 (TS) 和抗原呈递细胞 (APC) 产生的细胞因子– 而神经递质和神经肽是由神经元和神经胶质细胞产生的。正如我们现在所知，这种关系发生在细胞水平和分子水平。但近 25 年前，我们假设（药物研究进展30:345-363；1986）这种神经免疫或免疫神经回路的破坏实际上可能是导致各种脑部疾病和精神疾病的原因。

环境因素，如病毒或细菌感染、外伤或脑损伤和其他因素，很容易破坏这个回路。

为此，该领域最重要的发现之一是观察到神经系统自身免疫性疾病是神经免疫回路发生故障时最常见的问题。

这些在临床上已经被证实，并且开展自闭症、强迫症和抽动症患者的免疫治疗。神经免疫回路的破坏可能导致体内神经免疫失衡，从而可能影响大脑的可塑性。