益生元的价值是依附于益生菌的。针对益生元简单的说一句，益生元是益生菌的食物，最重要的是它只能刺激有益菌群的生长，而不刺激有潜在致病性或腐败活性的有害细菌繁殖增多。益生元不能被人体分解、吸收和利用，通过消化道到达结肠后，有的能被结肠群分解和利用，而促进结肠菌群的生长，在改善肠道微生态、 促进脂质、蛋白质与矿物类代谢方面具有重要意义。最典型的益生元有水苏糖、菊粉、低聚果糖等。