世界上最好的医生，莫过于我们的免疫系统了。免疫系统时刻监视着人体的异常情况，一旦发现病毒、细菌、肿瘤等敌对分子，就会奋勇作战。如果免疫系统紊乱，疾病就会趁机而入，人体的抵抗能力就会下降。

而肠神经系统和免疫系统的关系非常密切，肠道周围的免疫系统占了人体免疫系统的70%。这充分说明了肠神经系统对人体免疫系统的重要性。

神经系统和免疫系统在认识到危险因素时几乎在同时会协调一致地对危险做出反应。它们可以被视为统一的系统。

大多数人都认为人体的免疫细胞是在人体内四处巡逻的，这个观点现在看来并不准确。巡逻的免疫细胞只是一部分。越来越多的研究发现，人体内有很多只服务驻地组织或者器官的免疫细胞，跟社会上的驻地派出所里的片警一样，只在所驻扎的本地提供服务。

以胃肠道为例，以前人们并不知道这里有驻地的免疫细胞（Tissue-resident immune cells），最近几十年才知道在肠道上皮黏膜细胞之间还存在着上皮内淋巴细胞（IEL）可以提供防务。

 再往后又了解到人体肠道内还有三类其它免疫细胞，包括肌层巨噬细胞（只居住在肠道上皮的肌层），可以分泌抗体的B细胞，以及肥大细胞。