日常生活中，我们更多地认为心情是由思想控制的。这虽然是常识，但并非完全正确。荷尔蒙也十分影响我们的情绪，同时我们的情绪也受到免疫系统和肠道微生物的影响。精神压力是身体对生活压力的反应。它设法使身体恢复平衡，正常发挥免疫力，激素和神经的作用。来自生活和学习的压力都可能会导致菌群失衡、神经递质失衡和菌群失衡。无论哪种情况，都可以从免疫系统开始。

有一个统计数据，2008年金融危机的时候，因为生活压力香港的过敏人数比以前增加了10倍

肠道是人体最大的器官，肠道中微生物包括细菌，病毒，真菌等。微生物的平衡对于身心健康至关重要。而现代生活中的各个方面，例如压力大，加工食品饮食，抗生素，杀虫剂以及经过消毒的城市环境，都减少了健康肠道菌群的数量和丰富度，同时增加了有害菌群的数量。

一项2019年的研究将来自精神分裂症患者的粪便微生物移植物引入无菌小鼠中，发现这些小鼠随后表现出与精神分裂症有关的行为。同样，另一项研究指出对患有抑郁样特征的啮齿动物施用益生菌可以减少这些特征，从而使啮齿动物恢复正常行为。所有这些表明，肠道菌群的外部操纵具有进行新的心理健康治疗的潜力。

与健康个体相比，各种慢性疾病的患者的肠道菌群多样性和丰富性较少。《自然》杂志上的一项新研究发现，肠道微生物对于消除小鼠的恐惧反应至关重要。