辅酶Q10本身就是细胞内有效的抗氧化剂和自由基清除剂，它作为线粒体呼吸链的组成部分，包埋在线粒体内膜脂质双分子中，从线粒体复合体Ⅰ或复合体Ⅱ接受的2个电子后，变成醇式（还原性辅酶Q10），再将电子传递给复合体Ⅲ。体内辅酶Q10被大量消耗变成醇式，它既是有效的抗氧化剂，同时也是运动的电子载体。它将氢原子从其羟基转给脂质过氧化自由基，因而减少线粒体内膜的脂质过氧化物反应。