肠道菌群的组成成分经常处于动态变化中，随着婴儿的生长发育，肠道中的双歧杆菌和乳酸杆菌的数量会增加，而大肠杆菌的数量会减少。

双歧杆菌、乳酸杆菌是益生菌，可通过免疫排斥、免疫清除、免疫调节而发挥抗感染、抗过敏作用。

喂养方式也会影响婴儿肠道正常菌群的建立和构成，而肠道菌群组成成分及数量的改变，可使婴儿对通常无害的食物蛋白抗原缺乏耐受而发生过敏反应。