- ①利用扩展的基因集富集分析(GSEA),分析公开的人类GWAS和肠道菌群GWAS(GWASGM)数据,来检测肠道菌群与复杂疾病之间的关联;
- ②注意缺陷/多动症(ADHD)、自闭症谱系障碍(AUT)、双相障碍、精神分裂(SCZ)症和重度抑郁症(MDD)这5种精神疾病都与脱硫弧菌属显著相关;
- ③梭菌目与ADHD、MDD显著相关,拟杆菌属与AUT、MDD、SCZ显著相关,毛螺菌科与MDD显著相关;
- ④GSEA方法在探索肠道菌群与复杂疾病之间的关系上有着良好表现。
西安交大张峰团队近期在《Briefings in Bioinformatics》发表研究,将扩展的GSEA方法用于分析5种精神疾病遗传特征与肠道菌群的相关性,发现一系列肠道菌群与精神疾病有关联。该结果为分析精神疾病中肠道菌群的作用提供了新线索,值得参考。
Identifying psychiatric disorder-associated gut microbiota using microbiota-related gene set enrichment analysis
利用菌群相关基因集富集分析鉴定与精神疾病患者关联的肠道菌群
10.1093/bib/bbz034
2019-04-05, Article